Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A2Q01362 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms