Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB2Q00653 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFKB2Q00653 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NFKB2Q00653 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFKB2Q00653 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFKB2Q00653 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFKB2Q00653 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFKB2Q00653 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKB2Q00653 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms