Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK6Q00534 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms