Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VLDLRP98155 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VLDLRP98155 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms