Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX1P78414 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX1P78414 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRX1P78414 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRX1P78414 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRX1P78414 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRX1P78414 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IRX1P78414 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRX1P78414 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRX1P78414 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRX1P78414 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRX1P78414 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRX1P78414 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRX1P78414 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRX1P78414 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRX1P78414 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRX1P78414 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRX1P78414 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRX1P78414 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRX1P78414 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRX1P78414 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms