Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS25P62851 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS25P62851 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS25P62851 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS25P62851 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS25P62851 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS25P62851 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS25P62851 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS25P62851 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS25P62851 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS25P62851 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS25P62851 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS25P62851 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS25P62851 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS25P62851 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS25P62851 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS25P62851 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS25P62851 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS25P62851 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS25P62851 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS25P62851 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS25P62851 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS25P62851 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS25P62851 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms