Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VBP1P61758 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VBP1P61758 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VBP1P61758 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VBP1P61758 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VBP1P61758 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VBP1P61758 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VBP1P61758 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VBP1P61758 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VBP1P61758 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VBP1P61758 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VBP1P61758 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VBP1P61758 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VBP1P61758 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VBP1P61758 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VBP1P61758 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VBP1P61758 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VBP1P61758 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms