Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTBP60709 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTBP60709 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTBP60709 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTBP60709 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTBP60709 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTBP60709 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTBP60709 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTBP60709 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTBP60709 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTBP60709 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTBP60709 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTBP60709 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTBP60709 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms