Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPI1P60174 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPI1P60174 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPI1P60174 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPI1P60174 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPI1P60174 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPI1P60174 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPI1P60174 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPI1P60174 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms