Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms