Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP4P57796 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP4P57796 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP4P57796 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP4P57796 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP4P57796 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP4P57796 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP4P57796 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP4P57796 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP4P57796 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP4P57796 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP4P57796 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP4P57796 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP4P57796 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP4P57796 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP4P57796 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP4P57796 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP4P57796 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP4P57796 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP4P57796 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP4P57796 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP4P57796 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP4P57796 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP4P57796 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP4P57796 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP4P57796 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP4P57796 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP4P57796 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP4P57796 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP4P57796 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP4P57796 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP4P57796 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP4P57796 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP4P57796 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP4P57796 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP4P57796 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP4P57796 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP4P57796 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP4P57796 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP4P57796 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP4P57796 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP4P57796 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP4P57796 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP4P57796 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP4P57796 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP4P57796 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP4P57796 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP4P57796 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP4P57796 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP4P57796 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP4P57796 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP4P57796 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP4P57796 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP4P57796 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CABP4P57796 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP4P57796 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP4P57796 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP4P57796 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP4P57796 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP4P57796 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP4P57796 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms