Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX10P56693 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX10P56693 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX10P56693 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX10P56693 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX10P56693 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX10P56693 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX10P56693 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX10P56693 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX10P56693 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX10P56693 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX10P56693 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX10P56693 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX10P56693 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX10P56693 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX10P56693 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX10P56693 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX10P56693 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX10P56693 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX10P56693 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX10P56693 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX10P56693 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX10P56693 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX10P56693 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX10P56693 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX10P56693 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX10P56693 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX10P56693 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX10P56693 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX10P56693 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX10P56693 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX10P56693 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX10P56693 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX10P56693 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX10P56693 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms