Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms