Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELLP55199 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ELLP55199 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ELLP55199 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ELLP55199 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ELLP55199 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELLP55199 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms