Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms