Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIRAP54198 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIRAP54198 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIRAP54198 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HIRAP54198 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIRAP54198 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIRAP54198 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIRAP54198 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIRAP54198 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIRAP54198 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIRAP54198 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HIRAP54198 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HIRAP54198 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIRAP54198 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIRAP54198 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIRAP54198 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIRAP54198 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIRAP54198 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HIRAP54198 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIRAP54198 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIRAP54198 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIRAP54198 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HIRAP54198 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRAP54198 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRAP54198 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRAP54198 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRAP54198 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRAP54198 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRAP54198 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRAP54198 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRAP54198 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRAP54198 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRAP54198 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HIRAP54198 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HIRAP54198 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRAP54198 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRAP54198 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRAP54198 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRAP54198 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRAP54198 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRAP54198 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRAP54198 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRAP54198 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms