Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms