Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP11P51784 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP11P51784 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP11P51784 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP11P51784 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP11P51784 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP11P51784 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP11P51784 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP11P51784 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP11P51784 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP11P51784 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP11P51784 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP11P51784 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP11P51784 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP11P51784 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP11P51784 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms