Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK7P50613 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK7P50613 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK7P50613 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK7P50613 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK7P50613 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK7P50613 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK7P50613 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK7P50613 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK7P50613 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK7P50613 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK7P50613 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK7P50613 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK7P50613 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK7P50613 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK7P50613 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK7P50613 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK7P50613 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK7P50613 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK7P50613 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK7P50613 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK7P50613 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK7P50613 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK7P50613 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK7P50613 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK7P50613 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK7P50613 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK7P50613 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK7P50613 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK7P50613 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK7P50613 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK7P50613 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK7P50613 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK7P50613 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK7P50613 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK7P50613 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK7P50613 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK7P50613 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK7P50613 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK7P50613 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK7P50613 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK7P50613 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK7P50613 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK7P50613 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK7P50613 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK7P50613 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK7P50613 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK7P50613 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK7P50613 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms