Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBP50607 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBP50607 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBP50607 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBP50607 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBP50607 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBP50607 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBP50607 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBP50607 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBP50607 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBP50607 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBP50607 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBP50607 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBP50607 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBP50607 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBP50607 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBP50607 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBP50607 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBP50607 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBP50607 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBP50607 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBP50607 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms