Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms