Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NUP153P49790 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
NUP153P49790 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NUP153P49790 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NUP153P49790 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NUP153P49790 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NUP153P49790 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NUP153P49790 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP153P49790 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP153P49790 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUP153P49790 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP153P49790 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP153P49790 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUP153P49790 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP153P49790 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP153P49790 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP153P49790 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP153P49790 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP153P49790 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP153P49790 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP153P49790 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP153P49790 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP153P49790 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP153P49790 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP153P49790 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP153P49790 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP153P49790 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP153P49790 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP153P49790 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP153P49790 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP153P49790 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP153P49790 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP153P49790 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP153P49790 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUP153P49790 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUP153P49790 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUP153P49790 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NUP153P49790 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUP153P49790 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUP153P49790 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NUP153P49790 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NUP153P49790 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NUP153P49790 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NUP153P49790 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NUP153P49790 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUP153P49790 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUP153P49790 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUP153P49790 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUP153P49790 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP153P49790 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP153P49790 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP153P49790 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP153P49790 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP153P49790 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP153P49790 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP153P49790 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP153P49790 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP153P49790 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP153P49790 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NUP153P49790 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NUP153P49790 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NUP153P49790 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NUP153P49790 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NUP153P49790 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NUP153P49790 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUP153P49790 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUP153P49790 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUP153P49790 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUP153P49790 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUP153P49790 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUP153P49790 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NUP153P49790 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NUP153P49790 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NUP153P49790 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NUP153P49790 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NUP153P49790 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NUP153P49790 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP153P49790 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms