Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLK1P49759 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLK1P49759 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLK1P49759 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLK1P49759 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLK1P49759 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLK1P49759 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLK1P49759 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLK1P49759 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLK1P49759 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLK1P49759 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLK1P49759 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms