Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU3F4P49335 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms