Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms