Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITPNBP48739 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms