Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMTP48728 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMTP48728 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AMTP48728 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AMTP48728 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMTP48728 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMTP48728 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms