Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RXRGP48443 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RXRGP48443 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RXRGP48443 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RXRGP48443 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRGP48443 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRGP48443 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRGP48443 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRGP48443 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRGP48443 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRGP48443 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRGP48443 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms