Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5OP48047 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5OP48047 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms