Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSN1S1P47710 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms