Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRXP46100 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRXP46100 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRXP46100 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRXP46100 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRXP46100 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRXP46100 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRXP46100 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRXP46100 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRXP46100 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRXP46100 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRXP46100 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRXP46100 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRXP46100 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRXP46100 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRXP46100 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRXP46100 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRXP46100 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRXP46100 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRXP46100 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRXP46100 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRXP46100 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms