Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XCR1P46094 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XCR1P46094 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XCR1P46094 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XCR1P46094 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
XCR1P46094 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XCR1P46094 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XCR1P46094 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XCR1P46094 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XCR1P46094 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XCR1P46094 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XCR1P46094 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XCR1P46094 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XCR1P46094 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XCR1P46094 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XCR1P46094 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XCR1P46094 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XCR1P46094 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XCR1P46094 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XCR1P46094 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XCR1P46094 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XCR1P46094 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XCR1P46094 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
XCR1P46094 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XCR1P46094 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
XCR1P46094 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XCR1P46094 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XCR1P46094 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XCR1P46094 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XCR1P46094 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms