Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GATA4P43694 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA4P43694 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA4P43694 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA4P43694 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA4P43694 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA4P43694 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA4P43694 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA4P43694 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA4P43694 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA4P43694 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA4P43694 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GATA4P43694 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GATA4P43694 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GATA4P43694 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA4P43694 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA4P43694 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms