Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGER2P43116 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGER2P43116 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms