Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A1P43005 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms