Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms