Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms