Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDH1P40925 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDH1P40925 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDH1P40925 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MDH1P40925 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDH1P40925 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDH1P40925 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDH1P40925 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDH1P40925 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDH1P40925 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDH1P40925 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MDH1P40925 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDH1P40925 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDH1P40925 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDH1P40925 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDH1P40925 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDH1P40925 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDH1P40925 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDH1P40925 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDH1P40925 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MDH1P40925 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDH1P40925 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDH1P40925 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDH1P40925 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDH1P40925 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDH1P40925 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDH1P40925 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDH1P40925 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDH1P40925 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDH1P40925 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDH1P40925 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDH1P40925 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDH1P40925 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDH1P40925 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDH1P40925 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDH1P40925 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDH1P40925 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms