Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC26A3P40879 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC26A3P40879 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC26A3P40879 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC26A3P40879 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC26A3P40879 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC26A3P40879 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC26A3P40879 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC26A3P40879 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC26A3P40879 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC26A3P40879 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC26A3P40879 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC26A3P40879 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC26A3P40879 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC26A3P40879 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC26A3P40879 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms