Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 REH1YLR387C 1299 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 DUG3YNL191W 1074 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YBL096CYBL096C 309 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 AVT7YIL088C 1473 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 HCM1YCR065W 1695 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SWP82YFL049W 1872 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SRP72YPL210C 1923 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 RPN9YDR427W 1182 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YIP5YGL161C 933 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 RSM27YGR215W 333 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YIL025CYIL025C 375 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YKL162CYKL162C 1209 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YLR407WYLR407W 687 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YMR181CYMR181C 465 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 MRPS17YMR188C 714 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 POP3YNL282W 588 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YNL320WYNL320W 855 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 CIN5YOR028C 888 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 snR11snR11 258 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YOR338WYOR338W 1092 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YFL040WYFL040W 1623 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 PMS1YNL082W 2622 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 ATM1YMR301C 2073 nt3.5□□□□□ -1.85
AVT5P38176 HMG1YML075C 3165 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 FAS2YPL231W 5664 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 RTC1YOL138C 4026 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 PPZ1YML016C 2079 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SLX8YER116C 825 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 FMC1YIL098C 468 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 VPS25YJR102C 609 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 TRI1YMR233W 681 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 MCK1YNL307C 1128 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YGK3YOL128C 1128 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YBR287WYBR287W 1284 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 CTK1YKL139W 1587 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 MNT4YNR059W 1743 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SPT14YPL175W 1359 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SIP1YDR422C 2448 nt3.49□□□□□ -1.85
AVT5P38176 KTR6YPL053C 1341 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 MSN4YKL062W 1893 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 RPN4YDL020C 1596 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 VAC17YCL063W 1272 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SHU2YDR078C 672 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 RAV2YDR202C 1056 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YDR391CYDR391C 699 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 VAR1Q0140 1197 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YGL204CYGL204C 306 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 COX6YHR051W 447 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 AIM18YHR198C 966 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 AIM19YIL087C 474 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 IST3YIR005W 447 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YKR051WYKR051W 1257 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YAR023CYAR023C 540 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 RRN9YMR270C 1098 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 EOS1YNL080C 1101 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 CYC2YOR037W 1101 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 UAF30YOR295W 687 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 TAF14YPL129W 735 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 CCL1YPR025C 1182 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 GDT1YBR187W 843 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 RPB2YOR151C 3675 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SAG1YJR004C 1953 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 NUP133YKR082W 3474 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 UBP6YFR010W 1500 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 BRE4YDL231C 3378 nt3.48□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.47□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SSM4YIL030C 3960 nt3.47□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SPO73YER046W 432 nt3.47□□□□□ -1.85
AVT5P38176 ISC10YER180C 804 nt3.47□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YHL026CYHL026C 948 nt3.47□□□□□ -1.85
AVT5P38176 COS8YHL048W 1146 nt3.47□□□□□ -1.85
AVT5P38176 DOG2YHR043C 741 nt3.47□□□□□ -1.85
AVT5P38176 DOG1YHR044C 741 nt3.47□□□□□ -1.85
AVT5P38176 NCR1YPL006W 3513 nt3.47□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SWH1YAR042W 3567 nt3.47□□□□□ -1.85
AVT5P38176 TRE2YOR256C 2430 nt3.46□□□□□ -1.85
AVT5P38176 HMRA1YCR097W 381 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 SPR6YER115C 576 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 GTF1YGR102C 552 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YIL171WYIL171W 330 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 LOH1YJL038C 660 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 GON7YJL184W 372 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 FIP1YJR093C 984 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 RPL14AYKL006W 417 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 NDL1YLR254C 570 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 TEM1YML064C 738 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YNL296WYNL296W 315 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 TYE7YOR344C 876 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 MGR2YPL098C 342 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YBR053CYBR053C 1077 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YGL140CYGL140C 3660 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YHR202WYHR202W 1809 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 KRI1YNL308C 1776 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT5P38176 RDH54YBR073W 2877 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 PST1YDR055W 1335 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YIL001WYIL001W 1542 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 BUD6YLR319C 2367 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YPR022CYPR022C 3402 nt3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.4 ms