Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2IP36954 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms