Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT2P35908 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT2P35908 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT2P35908 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT2P35908 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT2P35908 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT2P35908 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT2P35908 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT2P35908 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT2P35908 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT2P35908 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT2P35908 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms