Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLC1P35663 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms