Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC1P35251 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFC1P35251 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC1P35251 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC1P35251 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC1P35251 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC1P35251 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms