Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA3P35244 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA3P35244 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA3P35244 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA3P35244 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA3P35244 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA3P35244 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPA3P35244 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPA3P35244 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA3P35244 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA3P35244 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA3P35244 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA3P35244 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA3P35244 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA3P35244 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA3P35244 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA3P35244 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA3P35244 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms