Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms