Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR1P32246 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR1P32246 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR1P32246 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR1P32246 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR1P32246 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR1P32246 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms