Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA7P31268 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms