Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPOP30536 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPOP30536 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPOP30536 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPOP30536 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSPOP30536 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TSPOP30536 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TSPOP30536 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms