Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms